芙登溪蜿蜒穿越其中的馬太鞍濕地，廣達十二公頃的面積，是花蓮縣面積最大的生態濕地。來自中央山脈的潔淨之水成就了馬太鞍濕地，不論是貫穿濕地的芙登溪或是水底伏流湧泉，都堪稱馬太鞍濕地的生命之泉。千百年來，馬太鞍部落的居民便以此濕地耕種捕魚，讓濕地成為馬太鞍部落最親密的生活區域。

馬太鞍濕地的生態豐富繁茂，光是鳥類資源就讓這裡成為東部的賞鳥重鎮，紅冠水雞、栗小鷺、黃小鷺、白腹秧雞、環頸雉、白腰文鳥、班文鳥等鳥種皆在濕地區出沒，甚至稀有的候鳥水雉也曾經南下至此度冬。近年來馬太鞍濕地更以栽種夏季景觀蓮花田聞名，賞蓮期限可至十月，與台灣西部的白河蓮田齊名，堪稱東台灣的美麗蓮鄉。深度遊耍馬太鞍濕地，最佳提案便是單車踩踏慢慢行，濕地區有規劃完善的單車路線，天開地闊、車輛稀少，踩踏板環遊生態濕地再是愜意不過。